Javaの開発環境

Eclipseでサーブレット開発環境を作る (Tomcat編)  2014年
Tomcatを使うなら「Eclipse IDE for Java EE Developers」でOK

改訂版：Eclipseではじめるプログラミング　(@IT)
Eclipse 3.4とJava 6
(すべて読むには2～3週間かかりそうな量)

■ DB接続
MySQLの常識を知りセットアップしてJSPからDB操作
Commons DBCPを超えるTomcat JDBC Poolとは

■ツール
Maven基礎  (slideshar)
Eclipse 4.2でMaven使えるようになるところまで

ビルドツールGradleのインストールと使い方、Jenkins/Git連携
GradleでEclipseとIntellij IDEAの開発環境を作る